Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnnd1P30999 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms