Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OatP29758 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OatP29758 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OatP29758 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms