Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrkcdP28867 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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