Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprmP28828 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprmP28828 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprmP28828 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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