Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col2a1P28481 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms