Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apex1P28352 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apex1P28352 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apex1P28352 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms