Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms