Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afxP27661 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afxP27661 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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