Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpl3P27659 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl3P27659 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms