Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfraP26618 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms