Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
U2af2P26369 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
U2af2P26369 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms