Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ChgaP26339 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms