Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HdcP23738 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HdcP23738 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HdcP23738 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HdcP23738 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms