Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NefhP19246 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NefhP19246 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NefhP19246 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NefhP19246 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NefhP19246 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms