Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RargP18911 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RargP18911 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RargP18911 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms