Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18529 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18529 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18529 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms