Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms