Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms