Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Lcn2P11672 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Lcn2P11672 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lcn2P11672 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lcn2P11672 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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