Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa1P11477 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms