Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc6P10629 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms