Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms