Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-T23P06339 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-T23P06339 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms