Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04214 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04214 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms