Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgfb1P04202 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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