Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ClppO88696 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ClppO88696 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ClppO88696 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ClppO88696 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ClppO88696 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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