Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vamp4O70480 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vamp4O70480 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms