Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lnx1O70263 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms