Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptpn20O55082 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms