Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdkO55028 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BckdkO55028 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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