Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2f6O54917 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2f6O54917 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms