Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Sp100O35892 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sp100O35892 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms