Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Timm44O35857 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Timm44O35857 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms