Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ccrl2O35457 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms