Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KeraO35367 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KeraO35367 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KeraO35367 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KeraO35367 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KeraO35367 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KeraO35367 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KeraO35367 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KeraO35367 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms