Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NmiO35309 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NmiO35309 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms