Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ebi3O35228 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ebi3O35228 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ebi3O35228 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ebi3O35228 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms