Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms