Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barx2O08686 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms