Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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