Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms