Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm4312K9J7E2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm4312K9J7E2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms