Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm11236J3QMS7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm11236J3QMS7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm11236J3QMS7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm11236J3QMS7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm11236J3QMS7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm11236J3QMS7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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