Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lipo1J3QME6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lipo1J3QME6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms