Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20825J3QM67 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms