Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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