Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm21411J3KMS0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21411J3KMS0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms