Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm20830J3KML6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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