Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2610008E11RikG3X964 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2610008E11RikG3X964 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms