Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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